いろいろとアドバイスを頂き、e2studioのGUI、PIN cnfigを使ってP111とP301のI/Oポートを出力（init:High）に変更が出来ました
また、hal_entryに以下のように書くことで、LEDを点灯させることが出来ました
while (1) { R_PORT1->PODR_b.PODR11 = 0; //P111にL出力 R_PORT3->PODR_b.PODR1 = 0; //P301にL出力 }
ありがとうございました
しかしながら、P110（ARDUINO_D12）とP109（ARDUINO_D11）は、選択できるModeがPeripheral ModeのみでI/Oポートを出力に変更出来ません
アドバイス、よろしくお願いいたします
GPIOで使いたい場合、SCI9の設定を解除してください。IO設定はペリフェラルが優先されます。
いろいろといじっていたら偶然分かりました
左側の画面で該当Pinを右クリックすると出てくる画面で、RXD9をP110に、TXD9をP109に、変更すればI/Oポートを出力（init:High）に変更が出来ました
お騒がせしました
引き続き、すぐに躓くと思うので、よろしくお願いします
ありがとうございます
解除方法は、右に出てくるICチップの図からの操作であっていますか？
他のよい方法があれば教えてください
以下のような画面になっていますが、これでよいのでしょうか？
赤×なので心配です